当时，知县的首要任务是执行朱元璋的休养生息政策，抓好农业生产。可马亮本来打算到督运部门工作。督运是明朝的经济部门，主要管理全国商业。各地虽然都设有督运官，但是督运官属中央直管，地方官员无权插手督运业务。马亮认为自己有这个能力，然而，他没想到自己得到的却是一个知县职务。因此，马亮上任后，常常摆出一副怀才不遇的样子，工作懈怠，政令执行不力。不过，马亮也不是无所事事。为了表现自己的才能，他帮助日照督运部门，狠抓日照的商业，做了不少大事儿。三年期满，知府给马亮的评语是：无课农兴学之绩而擅长督运。马亮看了这个评语，非常高兴。他想：有了这个评语，皇帝一定会重用自己。
没想到，朱元璋看了评语后问马亮：“你觉得你这个知县干得如何？”马亮回答道：“卑职在日照三年，日照的商业有了很大的改变！”接着，马亮历数自己在商业方面的贡献。朱元璋说：“可这些都是督运的工作呀！你分内的事做不好，其他事做得再好，还是不称职。我知道你在经商方面很有才能，原打算让你在基层锻炼一下，然后委以重任。可是，我如今怎么能重用一位不称职的官员呢？”就这样，朱元璋不仅没有给马亮提职，还免了他的知县之职，并且“永不录用”。